從基因到功能——心理所關于疾病相關非編碼區域的研究取得新進展

　　遺傳學因素在精神類疾患發生發展過程中的重要性已經得到公認。此外，影像遺傳學證據顯示，正常心理學現象中的行為/認知加工過程也表現出一定程度的遺傳相關性。目前已有大量精神疾患及行為/認知加工相關易感基因鑒定工作發表在心理學主流雜志上，但是這些易感基因的功能分析，尤其是針對非蛋白質編碼區域的功能研究有待取得進一步進展。針對這一現狀，中國科學院心理健康重點實驗室王晶研究組開發了用于分析疾病相關非編碼區域基因表達調控功能的分析型數據庫《調控型單核苷酸多態性位點數據庫》（Regulatory SNP database; rSNPBase）。這一數據庫近期已被國際著名的生物學雜志《Nucleic Acids Research》接收并發表。該數據庫可以通過http://rsnp.psych.ac.cn免費訪問。 

　　在該項研究中，王晶研究組依據實驗線索，對全基因組范圍內的單核苷酸多態性位點進行了四大類型的調控功能分析。這四類調控類型包括：近端轉錄起始調控，遠端轉錄起始調控，小RNA介導的轉錄后調控，及RNA結合蛋白介導的轉錄后調控。rSNPBase數據庫對上述分析得到的調控型單核苷酸多態性位點及被這些位點所調控的基因進行了系統性整合并分類展示。在此基礎上，數據庫進一步提供了調控行為發生的組織環境與發育階段環境，便于研究者依據自身研究所涉及的特定階段和組織特性選取信息。此外，數據庫對調控型單核苷酸多態性位點之間的連鎖不平衡關系也進行了分析并對結果予以展示，研究者可以從此數據庫檢索到DNA區間的調控屬性，而不局限于單一的核苷酸位點。最后，為了給研究者提供更多基因表達層面的研究證據，數據庫還整合了單核苷酸多態性位點的表達數量性狀屬性（eQTL）信息，其所采用的數據分析流程和信息整合模式確保了分析結果的可靠性。 

　　rSNPBase數據庫將銜接遺傳學研究與生物學功能性研究，為臨床精神病學家、心理學家及神經生物學家深入挖掘精神疾患及神經心理學現象的深層次生物機制提供有力的工具支持。 

　　此項研究得到了中科院知識創新工程項目（KSCX2-EW-J-8）、中國科學院/國家外國專家局創新團隊國際合作伙伴計劃（Y2CX131003）、中國科學院戰略性先導專項（B類）（XDB02030002）、國家自然科學基金（81201046及81101545）和中國科學院心理健康重點實驗室經費的資助。 

　　Guo LY, Du Y, Chang SH, Zhang KL & Wang J* (2013) rSNPBase: a database for curated regulatory SNPs. Nucleic Acids Research.doi:10.1093/nar/gkt1167